Este museo forma parte de la Plaza de las Tres Centurias, y opera desde marzo del 2003.
Se ubica en el edificio del Almacén de Carga construido a finales de 1800, el cual tenía la función de pesar y distribuir las diversas mercancías que se transportarían a través del servicio de carga del Express, entre las que destacaron el frijol, maíz, guayaba, pera y uva.
Actualmente resguarda una colección de más de diez mil piezas de maquinaria, herramientas, equipo y documentos de infraestructura ferroviaria, cuyo objetivo es difundir la historia del sistema ferroviario nacional y su impacto económico, político, social y cultural en el desarrollo de Aguascalientes a principios del siglo XX.